一、小反刍动物遗传资源保护技术研究进展（论文文献综述）
郭腾龙,汝振远,任尚,杨贤树,张翔栋,申屠璐燕,张运海,曹祖兵[1]（2021）在《牛早期妊娠诊断的研究进展》文中提出随着规模化、集约化养牛产业的飞速发展,急需更加准确、高效和方便的早期妊娠诊断方法,以缩短母牛产犊间隔,减少空怀期母牛饲养成本,提高养殖效益。目前养牛行业使用的早期妊娠诊断方法主要包括直肠触诊、超声波诊断以及通过检测妊娠相关生物标志物的免疫学诊断等。然而,这些早期妊娠诊断方法都存在一定的弊端,很难满足当前养牛行业的需求。本文阐述了几种早期妊娠诊断方法的优缺点,力求找出母牛最合适的早期妊娠诊断方法,以利于妊娠早期母牛的精细化管理和母牛繁殖效率的提高。
王凤红[2]（2021）在《山羊SNP芯片设计与内蒙古绒山羊重要经济性状全基因组关联分析及基因组选择研究》文中指出绒山羊是我国特色优势品种,所产山羊绒是我国唯一具有出口定价权的畜产品。内蒙古绒山羊因产绒量高、绒毛品质优良和遗传性能稳定而享誉世界。本研究基于课题组前期完成的不同山羊品种基因组、转录组数据筛选功能位点,研发出首张适用于国内地方山羊品种芯片,结合系谱和生产性能测定记录,构建了高质量参考群体,基于该芯片在内蒙古绒山羊群体内开展了全基因组关联分析及大数据基因组选择研究,对绒毛品质性状的遗传机理进行初步解析,确定了内蒙古绒山羊基因组选择最佳方法。本研究充分利用我国绒山羊种质资源优势,从基因组角度研究和挖掘一批与羊绒生产性状相关的分子标记和基因资源,为今后绒山羊遗传资源保护和利用提供科学依据,为内蒙古绒山羊优质高产新品系培育提供新的基因资源和理论指导。论文主要结果如下:1.基于课题组近30年测定积累的616 113条内蒙古绒山羊系谱和生产性能记录数据,通过ASREML软件,对内蒙古绒山羊重要经济性状进行遗传参数估计。结果表明:群、测定年份和个体年龄对各性状均有显着影响,可作为固定效应纳入模型。产绒量、绒细、毛长的遗传力分别是0.24、0.27、0.32,均属于中等遗传力（0.20-0.40）,体重和绒长属于低遗传力（0.12和0.14）。产绒量、体重、绒长、绒细、毛长之间的遗传相关在-0.32～0.40之间,表型相关在-0.02～0.20之间;发现各性状加性方差较前人研究减小,说明选育后的性状遗传变异减小,有利于选育目标性状的基因型得到有效选择和纯合性状表型更加整齐。2.利用36个典型的中国地方品种（372个个体）和49个国外品种（226个个体）的山羊基因组、转录组数据,同时最大化兼容Illumina山羊52K SNP芯片位点,添加课题组多年来积累的重要功能位点数据,累计约4 500万个MAF大于0.2的SNPs,采用条件性的多目标局域性优化算法,通过对SNPs严格筛选,最终保留67 088 SNPs位点,集成一款全新的山羊70K SNP芯片（GGP＿Goat＿70K）;基于山羊70K SNP芯片,在内蒙古绒山羊群体中进行基因分型测试,所有个体均成功分型,平均call rate98.8%。说明利用该芯片可以实现山羊的基因分型,同时获得了1 920个个体的基因型数据,可用于后续的GWAS和基因组选择研究。3.基于获得的1 920个个体的基因型数据,对内蒙古绒山羊的绒长、绒细和产绒量三个性状进行全基因组关联分析。首先对绒长、绒细和产绒量进行数据整理,检测表型数据是否符合正态分布;同时对内蒙古绒山羊群体进行主成分分析,判断是否存在群体分层现象;然后使用混合线性模型进行GWAS分析,通过分位数-分位数（Quantile-Quantile,Q-Q）图判断期望值和观测值的拟合程度。结果表明在基因组水平获得了4个显着SNPs,扩大100 kb后经注释发现GALNTL5、CCDC171、STUM、CMAS、FGF12、POLN、TACC3、PRLR、EVPL、COL3A1和SOX5为内蒙古绒山羊绒毛性状的重要候选基因,可以用于后续深入研究。4.基于70K SNP芯片在国内开展了绒山羊基因组选择研究,使用GBLUP和SSGBLUP方法估计了内蒙古绒山羊绒长、绒细、产绒量、体重和毛长5个性状的遗传力和基因组育种值,同时与研究一使用的ABLUP法获得的数据进行比较,并用5次重复的5倍交叉验证来评价育种值预测的准确性。结果表明（1）GBLUP和SSGBLUP法估计产绒量的遗传力为0.26和0.28;体重的遗传力为0.17和0.14;绒长的遗传力均为0.09;绒细的遗传力均为0.30;毛长的遗传力为0.31和0.32。（2）SSGBLUP对5个性状评估准确性在45%-82%之间,与ABLUP相比提高19%-25%;（3）SSGBLUP相比于GBLUP和ABLUP有更高的预测准确性和无偏性,SSGBLUP是内蒙古绒山羊基因组选择的最佳方法;（4）通过实施基因组选择可以使内蒙古绒山羊育种世代间隔从4.5年缩短至2年。
刘佳倩[3]（2021）在《平原地区舍饲条件下承德无角山羊种质特性研究》文中提出本研究利用常规试验方法,对平原地区舍饲条件下承德无角山羊的生长发育、行为学表现、常规生理指标、繁殖性能等进行了测定与分析,研究结果可为该山羊提纯复壮、选育优良后代、扩大种群规模奠定理论基础,为下一步深入开展种质资源评价与开发利用的研究保驾护航。研究结果表明:1.体重变化情况:在相同饲养条件下,承德无角公、母羊体重的累计生长、绝对生长和相对生长均有差异性。累计生长,6月龄、9月龄公母羊体重呈显着性差异（P<0.05）,12月龄公母羊呈极显着差异（P<0.01）;绝对生长,6月龄～9月龄公母羊呈显着性差异（P<0.05）,其他年龄段二者差异不显着（P>0.05）;相对生长,各年龄段均差异不显着（P>0.05）。综上分析,公羊各年龄段的体重均大于母羊,且公、母羊均为0～6月龄生长最快。2.体尺指标变化情况:在相同饲养条件下,承德无角公、母羊体尺指标之间多数存在显着（P<0.05）或极显着差异（P<0.01）,整体来看从0～6月龄达到生长高峰,且公羊均大于母羊。不同年龄的体重与各体尺指标大部分呈显着（P<0.05）或极显着（P<0.01）正相关,其中以胸围的相关性最大,说明胸围对体重影响较大。对成年羊体尺指标进行了回归分析并建立了最优回归方程:y=-66.42+0.61x4+0.30x3+0.29x1。3.行为学特点:采食行为中,3月龄在一天中所用时间最长,3组中两两呈极显着差异（P<0.01）;反刍行为中,12月龄在一天中所用时间最长,3月龄与其余两组呈极显着差异（P<0.01）;运动与卧息行为中,12月龄在一天中所用时间与其他两组呈极显着差异（P<0.01）。不同年龄承德无山羊均在上午采食持续时间最长。白昼与夜间各种行为所用时间大部分呈极显着差异（P<0.01）,其中采食主要集中在白昼,反刍与卧息主要集中在夜间。4.常规生理指标特点:承德无角山羊在不同生长时期常规生理指标均在正常范围之内。5.繁殖性能特点:初产母羊产羔率、断奶成活率和繁殖成活率依次为123.5%、78.6%和97.1%,经产母羊依次为111.1%、80.0%和88.9%。综上所述,从生长发育情况来看,承德无角山羊0～6月龄生长速度较快,体重和体尺相关性结果提示该山羊选种时除考虑体重外,需要将胸围作为重要参照指标。各行为表现符合品种特征,生理指标均在正常范围内,说明该山羊在平原地区适应性良好。从繁殖性能来看,一年四季均可产羔,产羔间隔为7～8个月,大部分集中于春季和夏季。
褚博[4]（2021）在《转口蹄疫VP1基因奶山羊体外胚胎生产及冷冻保存》文中研究指明胚胎体外生产和冷冻保存技术在家畜种质资源保存方面有重要应用价值。近年来,随着动物转基因技术研究的不断推进,各种转基因动物育种新材料不断出现,部分转基因动物已经进入安全性评价阶段,转基因动物新品种培育在家畜种业创新领域具有重要应用价值。目前,所有转基因动物育种材料均在封闭性条件下饲养管理,建立一套转基因动物种质材料保存和利用方法,对促进转基因育种研究有重要意义。口蹄疫病毒的抗原表位大部分集中在VP1上,作为主要的免疫原性蛋白激发Th、B细胞产生免疫应答。本实验室课题组前期制备了转口蹄疫VP1基因奶山羊,本研究通过对转基因奶山羊后代羊进行PCR鉴定,筛选出转基因阳性后代,并验证外源基因在转基因公羊精液中的整合情况。利用转基因公羊精液进行体外受精,获得转基因胚胎,同时采用Cryotop玻璃化冷冻技术,通过对早期囊胚冷冻、解冻复苏的效率和继续培养发育后囊胚扩张率来筛选出玻璃化冷冻保护剂组分并进行优化,并对冷冻复苏后的胚胎质量进行检测,对比其与正常胚胎的囊胚总细胞数、滋养层细胞数（TE）、内细胞团数（ICM）和细胞凋亡情况,确定了适合转基因山羊精液体外受精和胚胎冷冻保存条件,用于转基因山羊胚胎资源的保存和利用。获得如下结果:1.对14只转基因奶山羊后代进行颈静脉采血提取山羊血液基因组进行PCR鉴定,其中8只奶山羊确定为转口蹄疫VP1基因奶山羊（OFMDV-VP1）,4只母羊,4只公羊,同时提取4只公羊精液基因组进行鉴定,精液中也整合有外源基因。2.通过电刺激采精法采集转基因公羊精液,利用Percoll法处理精液进行体外受精,获得体外胚胎,并进行PCR鉴定,确定转基因胚胎,继续培养,用于后续试验进行冷冻保存和胚胎移植。3.确定了采用Cryotop法以40%EG+0.5mol/L L?proline作为冷冻保护剂,可用于转基因山羊胚胎的冷冻保存,冷冻解冻后复苏率89.9%,囊胚扩张率74.5%。对比正常胚胎与冷冻解冻复苏胚胎的囊胚细胞总数、TE、ICM和凋亡细胞数,均差异不显着（P>0.05）。用冷冻后复苏的胚胎进行胚胎移植,母羊妊娠率为50%,可用于临床应用,为转基因羊胚胎资源的冷冻保存及生产应用提供帮助。
张上哲[5]（2021）在《牦牛群体结构变异和驯化研究》文中提出家牦牛（Bos grunniens）和野牦牛（Bos mutus）都属于牛属（Bos）。以前的研究都认为家牦牛驯化自野牦牛。家牦牛在青藏高原游牧民族的生活中起着重要的作用,是人类在高海拔地区生存和生活的重要条件。先前的群体遗传学研究发现,家牦牛被驯化于距今约7100年前。驯化过程中,一些和神经系统相关的基因受到选择作用。在本研究中,主要完成了两个方面的研究内容:我们组装了一个染色体水平的家牦牛参考基因组序列,该基因组也是目前为止所有反刍动物中最高质量的参考基因组;我们使用群体水平的长读长全基因组测序数据,鉴定了家牦牛和野牦牛群体中的基因组结构变异,勾画了牦牛基因组结构变异图谱,揭示了基因组结构变异与牦牛驯化的关系。主要研究结果如下:（1）对家牦牛基因组测序和组装得到的基因组大小为2.83 Gb,Contig N50长度达到44.72Mb。利用Hi-C的测序结果对基因组序列的contig进行挂载,将其定位到31条染色体上,scaffold N50长度到达了114.39Mb。完成了家牦牛参考基因组从scaffold水平到染色体水平的升级。（2）对家牦牛中的重复元件、非编码元件和蛋白编码基因预测结果表明,家牦牛的基因组中,43.90%都是由重复序列组成,基因组中约有0.72%的序列编码多种非编码RNA,基因组共预测得到了21232个蛋白编码基因,与使用Illumina序列组装的基因组结果类似。对蛋白编码基因的功能注释显示,97%的编码基因都有相应的功能。（3）对家牦牛基因组和其他多个物种的基因家族研究显示,牦牛基因组中的全部基因能够聚类为15662个基因家族,提取这些基因家族中鉴定获得的单拷贝基因构建最大似然树发现:家牦牛和野牦牛在系统发育树上为姊妹枝,它们一起和野牛属的北美野牛（Bison bison）、欧洲野牛（Bison bonasus）关系更近;而与牛属其它物种相对较远。（4）基于长读长、短读长和基因组组装之间鉴定得到的结构变异分别为372903,125531和353307个,这些结构变异代表了牦牛完整的结构变异遗传图谱。对结构变异相关序列的分析结果表明,导致结构变异发生的主要是重复序列,而不同长度的结构变异又包括不同类型的重复序列。（5）借助三代全基因组测序,对23个家牦牛和6个野牦牛进行了结构变异的鉴定和群体遗传学研究。通过评估群体之间高分化的结构变异,获得了可能是驯化过程中受选择的3680个结构变异,这些结构变异涉及725个蛋白编码基因区域。对上述结构变异相关的基因进行功能富集发现,它们主要和神经系统的发育,精神疾病等驯化综合征的表型相关,也有一些基因与驯化动物的经济性状相关,如免疫,脂肪存储和生殖等。综上所述,从遗传资源的角度来看,本研究组装了一个高质量的家牦牛参考基因组,并报道了首个牦牛的基因组结构变异图谱,为后续的牦牛遗传学研究提供了珍贵的遗传资源和材料。从牦牛驯化的角度,我们还揭示了基因组结构变异和牦牛驯化的关系,对目前研究较少的非模式生物的群体结构变异挖掘提供了整合的方法,为动物驯化的遗传学机制研究提供了新的视角。
巴恒星,胡鹏飞,李春义[6]（2021）在《鹿科动物基因组学研究进展》文中研究表明鹿科动物是世界上最丰富的大型哺乳动物之一,在极北地区、热带地区和高海拔地区都有分布。中国占世界鹿科动物40%以上,是鹿科动物进化的主战场。鹿科动物除了具有反刍动物常见的独特表型特征外,更是进化出周期性再生新器官——鹿茸角。鹿科动物是研究生态学、行为学和进化生物学非常有价值的动物模型,特别是在研究哺乳动物器官再生方面具有重要科学价值。鹿基因组是系统阐述鹿的进化和演变,解析鹿科动物独特生物学性状的依据,对遗传资源保护和利用具有重要意义。目前,随着鹿科动物参考基因组的不断完善,在鹿基础科学研究上取得了诸多重要成果。本文详细综述了鹿科动物基因组学研究进展,主要包括鹿遗传变异数据、适应性进化分子基础、独特性状鹿茸角的起源进化关键基因和功能基因组学,以期为鹿科动物的深入研究奠定理论基础。
王荣斌[7]（2020）在《陕北白绒山羊农户舍饲养殖典型日粮分析研究》文中研究表明本研究针对陕北白绒山羊农户舍饲养殖常用典型日粮使用情况开展实地调研分析,调查研究的范围涉及陕西省榆林市横山区的7个乡（镇）18个行政村。采用的主要方法技术包括文献查阅、现场访谈、问卷调查、抽样分析和综合比较等。通过实地调查总结提出农户养殖绒山羊常用的典型日粮及其组分,在评定常用粗饲料营养价值的基础上,评估常用典型日粮的营养水平及其毒素污染情况,以期为农户舍饲养殖陕北白绒山羊的日粮配制提供依据。获得的主要结果包括:1.在调查分析研究中,依据入户问卷调查的39个种养结合农户的绒山羊舍饲饲养情况,把农户在一年中不少于3个季度都使用的饲料定义为常用日粮组分,调研共得到17种常用的日粮组分,典型使用的日粮组分有8种,分别为玉米籽实、玉米秸秆、苜蓿、谷子秸秆、豆秸秆、高粱秸秆、柠条和玉米芯;再依据农户舍饲养殖绒山羊日粮组分的多少,可以把农户舍饲饲养绒山羊常用的典型日粮总结为2个,即使用4种日粮组分的玉米籽实、玉米秸秆、苜蓿和豆秸秆这一组合,及使用5种日粮组分的玉米籽实、玉米秸秆、苜蓿、谷子秸秆和豆秸秆,占比分别为12.82%和30.77%。2.调查分析表明,39个舍饲养殖户玉米种植面积和苜蓿种植面积差异不显着,可是,绒山羊存栏数量却与玉米种植面积,以及粗饲料种类呈现显着相关（p<0.05）;采用6种以上日粮组分的第三类型的农户饲养的羊单位达到217.21只,其饲料成本较低,为609.49元/只/年。3.在8种典型使用的日粮组分中选取了6种常用的粗饲料进行营养价值的评定,评定结果表明:苜蓿、柠条、玉米秸秆、高粱秸秆、谷子秸秆和豆秸秆等6种粗饲料的DM和CP在48h内的降解速率较高,在48h～72h的降解速率较低;苜蓿和柠条的DM和CP瘤胃降解特性较好,其中苜蓿和柠条的DM瘤胃有效降解率分别为56.35%和45.02%,二者CP有效降解率分别为66.15%和63.94%;玉米秸秆CP的瘤胃有效降解率较高,达61.83%,高粱秸秆DM的有效降解率较高,达47.58%;豆秸秆的DM和CP瘤胃有效降解率较差,分别为47.46%和55.42%。4.在农户舍饲养殖户采用的草棚和露天存储饲料方式下,获得了8种典型使用的日粮组分的7种,均检测出黄曲霉毒素B1,其中露天存储的黄曲霉毒素B1产生量高于草棚存储的;进一步的分析表明,7种日粮组分和2个典型日粮,其黄曲霉毒素B1含量均低于30μɡ/kg,未超国标要求。5.综合比较分析表明,上述典型日粮的营养水平不能满足配种前期和配种期种公羊,以及体重达45kg以上的泌乳期母羊的营养需要。为此,提出了可以满足陕北白绒山羊不同生理期的改进的日粮及其组分比例,并配套提出了建议。
杨万宗[8]（2020）在《荞麦秸秆日粮中添加甘露寡糖对滩羊生产性能、免疫和抗氧化功能的影响》文中认为过去几十年内因为抗生素的广泛应用,畜牧业得到迅速发展,而在畜禽疾病得到控制的同时抗生素也带来了一系列负面影响,如细菌出现耐药性、超级细菌的出现、环境污染等。众多研究结果表明甘露寡糖是抗生素有效替代品之一,对动物具有积极影响。本试验通过饲养试验、屠宰试验、消化代谢试验,开展了日粮中添加甘露寡糖对宁夏滩羊生长性能、屠宰性能、肉品质、消化代谢、免疫和抗氧化功能以及瘤胃发酵参数影响的研究,为滩羊的绿色、高效养殖和秸秆饲用化技术提供科学依据。试验选取健康无病、平均体重30.5kg的宁夏滩羊20只,随机分为4组,每组5只,独笼饲养。对照组和试验Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组分别饲喂基础日粮、基础日粮+1%MOS、基础日粮+2%MOS和基础日粮+3%MOS,试验以纤维素酶处理荞麦秸秆后,再与玉米青贮以40:60混合作为试验羊粗饲料,基础日粮精粗比均为30:70。结果表明:（1）日粮中添加甘露寡糖对试验0d、30d、60d时滩羊瘤胃pH和氨态氮浓度无显着影响（P>0.05）;而TVFA、乙酸、丁酸、异丁酸、戊酸、异戊酸含量和乙酸/丙酸比值均随甘露寡糖添加量增加呈“先升高后降低”趋势（P>0.05）,对照组均为最低,试验Ⅱ组均为最高（除异戊酸）,试验Ⅰ、Ⅱ组乙酸含量显着高于试验Ⅲ组（P<0.05）。对滩羊ADF表观消化率、进食氮、粪氮、尿氮、消化氮、沉积氮、氮表观消化率以及能量代谢也无显着影响（P>0.05）;添加甘露寡糖后DM、NDF表观消化率显着高于对照组（P<0.05）,试验Ⅰ组DM（60.37%）、NDF（59.32%）表观消化率最高;与对照组相比,试验组总排出氮显着降低、氮利用率和氮的生物学价值显着提高,试验Ⅰ组总排出氮（P<0.01）最低、氮利用率（P<0.01）和氮的生物学价值最高,值分别为6.71g/d、55.43%、85.4%;粪能和尿能最低,代谢能和总能代谢率最高（P>0.05）。（2）日粮中添加甘露寡糖对试验0d、30d、60d时滩羊血清尿素、甘油三酯、总胆固醇和游离脂肪酸含量无显着影响（P>0.05）;添加甘露寡糖后血清蛋白和葡萄糖含量均有提高,与对照组相比,试验Ⅱ、Ⅲ组在60d时总蛋白、白蛋白、球蛋白含量极显着提高（P<0.01）,球蛋白与白蛋白比值和葡萄糖含量显着提高（P<0.05）。（3）日粮中添加甘露寡糖能提高羊的免疫力和抗氧化能力,试验30d、60d时滩羊血清免疫球蛋白含量（IgA、IgG、IgM）和抗氧化酶活性（T-AOC、T-SOD）均随甘露寡糖添加量增加呈“先升高后降低”的变化趋势;甘露寡糖添加量为2%时,试验30d的IgA和IgM浓度、60d的IgG浓度、60d的T-SOD活性显着高于对照组（P<0.05）,30d和60d时的MDA含量最低（P>0.05）。（4）日粮中添加甘露寡糖对滩羊的平均日增重、料重比、体长增长量、体高增长量、羊肉失水率、羊肉pH值以及屠宰性能指标影响不显着（P>0.05）;试验Ⅰ组滩羊胸围增长量和眼肌面积较对照组显着提高（P<0.05）,同时总增重、平均日增重、净肉重、胴体净肉率（49.03%）和纯利润达到最高,料重比和骨肉比最小,但差异均不显着（P>0.05）;试验Ⅱ组羊肉剪切力、滴水损失、肉色黄度和亮度值较对照组显着降低（P<0.05或P<0.01）,大理石纹评分和熟肉率（60.28%）达到最高（P>0.05）。综上所述,在本试验条件下日粮中添加1-2%甘露寡糖能提高滩羊的生产性能、屠宰性能、免疫和抗氧化能力以及瘤胃发酵参数,能促进营养物质、氮和能量的消化代谢,改善羊肉品质。
吴璇[9]（2020）在《2035kg川中黑山羊公羊能量和蛋白质需要量研究》文中研究表明本研究以20～35 kg川中黑山羊公羊为研究对象,开展其能量和蛋白质需要量研究,旨在为我国肉羊饲养标准的完善提供数据参考。选取2.5月龄19.97±5.47kg健康断奶川中黑山羊去势公羔22只,采用单因素完全随机区组试验设计,其中18只分为3个处理组:100%自由采食组（Ad libitum）、75%自由采食组（AL75）、60%自由采食组（AL60）,每个处理组6只羊,单笼单饲,开展饲养试验、消化代谢试验和比较屠宰试验。预饲期14 d,正式试验82 d。消化代谢试验在饲养试验结束前4天开展,收集全粪全尿;饲养试验开始前屠宰4只羔羊,待AL组羔羊平均体重达35 kg时结束试验,每处理组选4只羊（共12只）进行屠宰。根据屠宰试验结果,采用析因法计算20～35 kg川中黑山羊公羊的能量和蛋白质需要量。结果表明:（1）生产性能:AL组、AL75组和AL60组全期干物质采食量分别为912 g/d、706 g/d、544 g/d,饲喂水平差异极显着（P<0.01）,平均日增重分别为157 g、115 g、58 g,各组间差异极显着（P<0.01）,料重比分别为6.70、7.01、12.18,AL60组显着高于AL组和AL75组（P<0.05）。（2）屠宰性能:AL组试验结束时宰前活重33.28 kg、屠宰率为53.3%、净肉率为41.43%、胴体净肉率为77.16%、骨肉比为0.37。（3）脏器指数:AL组、AL75组和AL60组的心脏器官指数分别为0.43%、0.45%、0.42%,差异不显着（P>0.05）,肝脏器官指数分别为1.93%、1.79%、1.71%,AL组极显着高于AL75组和AL60组（P<0.01）,脾脏器官指数分别为0.16%、0.17%、0.15%,差异不显着（P>0.05）,肺脏器官指数分别为1.14%、1.40%、1.36%,差异不显着（P>0.05）,肾脏器官指数分别为0.34%、0.31%、0.26%,随饲喂水平下降显着降低（P<0.01）,皮毛器官指数分别为7.94%、8.66%、8.43%,差异不显着（P>0.05）。其中肝脏及肾脏在脏器中受限饲影响最大。（4）能量和营养物质消化率:AL组日粮干物质、粗蛋白质、中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维和总能的表观消化率分别为72.70%、69.61%、40.08%、33.33%和68.71%,净蛋白利用率19.77%,总能代谢率59.20%、消化能代谢率87.28%。（5）维持能量和蛋白质需要量:维持净能需要量为178.24 k J/kg·BW0.75·d,维持代谢能需要量为263.74 k J/kg·BW0.75·d。代谢能维持利用效率（km）为0.68,代谢能生长利用效率（kg）为0.3147。维持净蛋白质需要量为1.60 g/kg·BW0.75·d。（6）能量和蛋白质需要量预测模型20～35 kg川中黑山羊公羊的净能、代谢能以及净蛋白质需要量的预测模型分别如下:净能需要量（NER）的预测模型为:NER=NEm（维持净能）+NEg（生长净能）,式中NEm=178.24k J/kg·BW0.75·dLog10（ER）=0.429+1.391×log10（EBW,空腹体重）EBW（kg）=-0.1183+0.8697×BW（活体重,kg）代谢能需要量（MER）的预测模型为:MEm=MEm+MEg,式中MEm=263.74 k J/kg·BW0.75·d,MEg=NEg/kg,kg=0.3147log10（ER）=0.429+1.391×log10（EBW）EBW（kg）=-0.1183+0.8697×BW（kg）净蛋白质需要量（Np R）的预测模型为:Np R=Npm+Npg,式中NPm=1.60 g/kg·BW0.75·d log10（NR）=-0.672+1.033×log10（EBW）EBW（kg）=-0.1183+0.8697×BW（kg）
柏妍[10]（2020）在《牛至精油替代莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃功能和生长性能的影响》文中提出为了研究牛至精油（OEO）的替抗作用,本试验以70日龄（d）的荷斯坦奶公犊为研究对象,系统研究了OEO,莫能菌素（MON）及两者混合对奶公犊瘤胃功能及生长发育的影响,以期为OEO代替MON在畜牧生产中实现无抗养殖提供理论依据。试验采用两因素完全随机试验设计,选择12头遗传背景一致,体重相近（kg）,体况良好的70 d荷斯坦奶公犊,随机分为4组,每组3头,单栏饲养至310 d,试验期240天。对照组（CON）:饲喂基础日粮;牛至精油组（OEO）:基础日粮+26 mg/kg DM牛至精油;莫能菌素组（MON）:基础日粮+25 mg/kg DM莫能菌素;混合组（OEO+MON）:基础日粮+26 mg/kg DM OEO和25 mg/kg DM MON。本试验首先通过16S r DNA高通量测序分析OEO和MON对瘤胃微生物区系的影响,进而研究OEO和MON对瘤胃发酵参数和微生物酶活性的影响;根据OEO和MON对血清指标的影响,再结合微生物区系、瘤胃发酵参数和微生物酶活性,揭示最终引起荷斯坦奶公牛生长性能差异的主要原因。主要研究结果如下:试验一:饲粮添加OEO和MON及其两者混合物对荷斯坦奶公牛瘤胃微生物区系的影响。试验采用16S r DNA高通量测序鉴定分析了OEO和MON及其二者的混合物对奶公牛不同发育阶段瘤胃微生物区系的影响,结果表明:1)门水平上,在70-190 d,OEO和MON对瘤胃中Firmicutes、Spirochaetes、Fibrobacteres和Synergistetes有显着的交互作用（P≤0.05）;从主效应分析,MON显着提高了瘤胃中Proteobacteria的相对丰度（P<0.05）,极显着提高了Actinobacteria的相对丰度（P<0.01）。在191-310 d,OEO和MON对瘤胃中Proteobacteria的相对丰度有极显着的交互作用（P<0.01）,对Actinobacteria的相对丰度有显着交互作用（P<0.05）;从主效应分析,OEO显着提高了瘤胃中Firmicutes和Spirochaetes的相对丰度（P<0.05）,极显着降低了Bacteroidetes的相对丰度（P<0.01）;MON极显着提高了瘤胃中Bacteroidetes和Fibrobacteres的相对丰度（P<0.01）,极显着降低了Firmicutes的相对丰度（P<0.01）。2)科水平上,在70-190 d,OEO和MON在影响瘤胃中Veillonellaceae、Clostridiaceae、Christensenellaceae、Fibrobacteraceae、Spirochaetaceae、Coriobacteriaceae和其它菌科的相对丰度方面具有显着交互作用（P<0.05）,对Porphyromonadaceae有极显着的交互作用（P<0.01）;从主效应分析,MON极显着提高了瘤胃中Prevotellaceae和Succinivibrionaceae的相对丰度（P<0.01）,极显着降低了Ruminococcaceae的相对丰度（P<0.01）,显着降低了Eubacteriaceae的相对丰度（P<0.05）。在191-310d,OEO和MON对瘤胃中Porphyromonadaceae、Veillonellaceae、Christensenellaceae和Succinivibrionaceae的相对丰度方面具有极显着的交互作用（P<0.01）,对Rikenellaceae和Fibrobacteraceae有显着的交互作用（P<0.05）;从主效应分析,OEO极显着降低了瘤胃中Prevotellaceae的相对丰度（P<0.01）,显着提高了Lachnospiraceae、Spirochaetaceae和其它菌科的相对丰度（P<0.05）;MON极显着提高了Prevotellaceae的相对丰度（P<0.01）,极显着降低了Ruminococcaceae的相对丰度（P<0.01）,显着降低了Eubacteriaceae、Clostridiaceae和其它菌科的相对丰度（P<0.05）。3)在属水平上,在70-190 d,OEO和MON在影响瘤胃中Paraprevotella、Ruminococcus和Saccharofermentans的相对丰度方面具有显着的交互作用（P<0.05）,对Acetivibrio有极显着的交互作用（P<0.01）。从主效应分析,OEO显着降低了瘤胃中未分类LachnospiraceaeNA的相对丰度（P<0.05）,MON极显着提高了Prevotella的相对丰度（P<0.01）,极显着降低了RuminococcaceaeNA和Eubacterium的相对丰度（P<0.01）,显着降低了PorphyromonadaceaeNA的相对丰度（P<0.05）。在191-310 d,OEO和MON对影响瘤胃中PorphyromonadaceaeNA和Saccharofermentans的相对丰度方面有显着的交互作用（P<0.05）,对Paraprevotella有极显着的交互作用（P<0.01）。从主效应分析,OEO极显着降低了瘤胃中Prevotella的相对丰度（P<0.01）,极显着提高了LachnospiraceaeNA的相对丰度（P<0.01）,显着提高了RuminococcaceaeNA、Butyrivibrio和其它菌属（P<0.05）;MON极显着提高了Prevotella的相对丰度（P<0.01）,极显着降低了RuminococcaceaeNA和Eubacterium的相对丰度（P<0.01）,显着降低了Rikenella的相对丰度（P<0.05）。试验二饲粮添加OEO和MON对荷斯坦奶公牛瘤胃发酵参数和微生物酶活性的影响。结果表明:1)从交互作用分析,在70-190 d,饲粮中单独添加OEO显着提高了瘤胃中丙酸百分含量,显着降低了A/P值（P≤0.05）;单独添加MON显着提高了丙酸百分含量（P<0.05）,显着降低了A/P值和丁酸的百分含量（P≤0.05）,同时添加两种添加剂对以上发酵参数以及异丁酸产生显着的交互作用（P<0.05）,对异丁酸百分含量有极显着的交互作用（P<0.01）。从主效应分析,OEO显着提高了异戊酸的百分含量（P≤0.05）;MON显着降低了TVFA和乙酸的浓度（P<0.05）。在191-310d,饲粮中单独添加OEO或MON均显着提高了丙酸浓度和丙酸百分含量（P<0.05）,同时添加两种添加剂则产生显着的交互作用（P<0.05）。从主效应分析,OEO或MON均显着降低了瘤胃中NH3-N的浓度（P<0.05）;MON极显着降低了瘤胃中乙酸和丁酸的浓度（P<0.01）,显着降低了异丁酸的浓度（P<0.05）。2)从交互作用分析,在70-190 d单独添加OEO显着提高了犊牛期瘤胃中α-淀粉酶、纤维素酶和β-葡萄糖苷酶的活性（P≤0.05）,单独添加MON显着提高了α-淀粉酶的活性（P≤0.05）,同时添加OEO和MON产生显着的交互作用（P<0.05）。从主效应分析,OEO显着提高了木聚糖酶的活性（P<0.05）,MON显着提高了胃蛋白酶的活性（P<0.05）。在191-310 d,从交互作用分析,单独添加OEO显着降低了瘤胃中胃蛋白酶活性,提高了α-淀粉酶、纤维素酶、β-葡萄糖苷酶、微晶纤维素酶和木聚糖酶活性（P≤0.05）,单独添加MON显着提高了瘤胃液中胃蛋白酶、α-淀粉酶和β-葡萄糖苷酶的活性（P≤0.05）,同时添加两种添加剂对胃蛋白酶、纤维素酶、β-葡萄糖苷酶和木聚糖酶活性产生显着的交互作用（P<0.05）,对β-葡萄糖苷酶有极显着的交互作用（P<0.01）。试验三饲粮添加OEO和MON对荷斯坦奶公牛生长性能的影响。结果表明:单独添加OEO显着提高了190 d和310 d奶公牛的体重,以及70-310 d总增重,191-310 d和70-310 d的平均日增重（ADG）和干物质采食量（DMI）（P≤0.05）;单独添加MON显着提高了190 d、310 d的体重以及70-190 d的总增重和ADG（P≤0.05）,混合添加两种添加剂则产生显着的交互作用（P≤0.05）,主要表现为拮抗作用。试验四饲粮添加OEO和MON对荷斯坦奶公牛血清指标的影响。结果表明:从交互作用分析,单独添加OEO显着提高了191-310 d和70-310 d血清中总蛋白（TP）的浓度（P≤0.05）,同时添加OEO和MON有显着的交互作用（P<0.05）。MON显着提高了70-310 d的甘油三酯（TG）浓度,而同时添加两种添加剂产生显着的交互作用（P<0.05）。从主效应分析,OEO显着提高了70-190 d过氧化物歧化酶（SOD）的浓度（P≤0.05）,显着提高了70-310 d血清白蛋白（ALB）的浓度（P≤0.05）。MON显着降低了190 d、70-190 d和70-310 d血清中尿素氮（BUN）的浓度（P≤0.05）。综上所述:饲粮添加牛至精油能有效改变荷斯坦奶公牛的瘤胃微生物群落结构,调控瘤胃发酵,降低瘤胃NH3-N浓度,提高丙酸浓度,改善荷斯坦奶公牛生长性能,并对动物机体抗氧化能力和免疫功能具有一定的改善作用。综合考虑,牛至精油可考虑作为潜在的莫能菌素替代物应用于荷斯坦奶公牛实际生产中。
二、小反刍动物遗传资源保护技术研究进展（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、小反刍动物遗传资源保护技术研究进展（论文提纲范文）
（1）牛早期妊娠诊断的研究进展（论文提纲范文）
| 1 临床诊断 |
| 1.1 直肠检查 |
| 1.2 超声波诊断法 |
| 2 免疫学诊断 |
| 2.1 孕酮(P4)检测 |
| 2.2 早期妊娠因子(EPF)检测 |
| 2.3 妊娠相关蛋白(PAGs)检测 |
| 2.4 IFN-τ检测 |
| 3 展望 |
（2）山羊SNP芯片设计与内蒙古绒山羊重要经济性状全基因组关联分析及基因组选择研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 缩略语表 |
| 1 引言 |
| 1.1 绒山羊育种研究进展 |
| 1.1.1 绒山羊概述 |
| 1.1.2 绒山羊育种现状 |
| 1.2 SNP芯片的研究进展 |
| 1.2.1 SNP分型芯片的特点 |
| 1.2.2 SNP分型芯片的分类及原理 |
| 1.2.3 SNP分型芯片在畜牧领域的概况及应用 |
| 1.3 全基因组关联分析研究进展 |
| 1.4 羊基因组选择研究进展 |
| 1.4.1 基因组选择理论 |
| 1.4.2 基因组选择方法 |
| 1.4.3 基因组选择影响因素 |
| 1.4.4 羊基因组选择研究进展 |
| 1.5 研究目的及意义 |
| 1.6 技术路线图 |
| 2 研究一 内蒙古绒山羊重要经济性状遗传参数的评估 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 数据来源 |
| 2.1.2 非遗传因素分析-广义最小二乘法 |
| 2.1.3 多性状重复力混合模型估计遗传参数 |
| 2.2 结果 |
| 2.2.1 基本统计分析 |
| 2.2.2 固定效应的确定 |
| 2.2.3 遗传参数估计 |
| 2.3 讨论 |
| 2.3.1 遗传力 |
| 2.3.2 遗传相关 |
| 2.4 小结 |
| 3 研究二 山羊70KSNP芯片的研发设计与测试 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 芯片设计数据来源 |
| 3.1.2 芯片测试数据来源 |
| 3.1.3 主要分析软件及工具 |
| 3.1.4 主要试剂及仪器 |
| 3.1.5 位点筛选 |
| 3.1.6 位点优化 |
| 3.1.7 DNA提取 |
| 3.1.8 基因分型 |
| 3.2 结果 |
| 3.2.1 70K SNP芯片的设计 |
| 3.2.2 70K SNP芯片与Illumina 52K SNP芯片的比较 |
| 3.2.3 位点检出率 |
| 3.2.4 位点MAF统计 |
| 3.3 讨论 |
| 3.4 小结 |
| 4 研究三内蒙古绒山羊重要经济性状全基因组关联分析 |
| 4.1 材料与方法 |
| 4.1.1 样品采集 |
| 4.1.2 表型数据处理 |
| 4.1.3 数据质控 |
| 4.1.4 全基因组关联分析 |
| 4.1.5 GO、KEGG富集分析 |
| 4.2 结果 |
| 4.2.1 表型数据的基本统计 |
| 4.2.2 数据质控及群体遗传结构分析 |
| 4.2.3 绒长性状的全基因组关联分析 |
| 4.2.4 绒细性状的全基因组关联分析 |
| 4.2.5 产绒量性状的全基因组关联分析 |
| 4.2.6 功能富集分析 |
| 4.3 讨论 |
| 4.4 小结 |
| 5 研究四内蒙古绒山羊重要经济性状基因组选择研究 |
| 5.1 材料与方法 |
| 5.1.1 构建参考群 |
| 5.1.2 基因型数据 |
| 5.1.3 GBLUP |
| 5.1.4 SSGBLUP |
| 5.1.5 基因组准确性评估 |
| 5.1.6 世代间隔 |
| 5.2 结果 |
| 5.2.1 群体结构和遗传参数 |
| 5.2.2 基因组预测准确性比较 |
| 5.2.3 世代间隔 |
| 5.2.4 选择效果分析 |
| 5.3 讨论 |
| 5.4 小结 |
| 6 结论 |
| 7 创新点 |
| 8 展望 |
| 致谢 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 作者简介 |
（3）平原地区舍饲条件下承德无角山羊种质特性研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第一章 文献综述 |
| 1.1 山羊的起源、分化及我国山羊品种、遗传资源概况 |
| 1.1.1 山羊的起源与分化研究 |
| 1.1.2 我国山羊品种及遗传资源概况 |
| 1.2 我国地方山羊品种生长发育与繁殖性能研究进展 |
| 1.2.1 生长发育研究进展 |
| 1.2.2 繁殖性能研究进展 |
| 1.3 家畜行为学及羊行为学研究进展 |
| 1.4 承德无角山羊种质特性 |
| 1.4.1 原产地自然生态条件 |
| 1.4.2 外貌特征 |
| 1.4.3 生活习性 |
| 1.4.4 生长发育 |
| 1.4.5 繁殖性能 |
| 1.5 我国地方山羊品种发展现状及保护对策 |
| 1.5.1 地方山羊品种发展现状 |
| 1.5.2 地方山羊品种保护对策 |
| 1.6 研究目的、意义和内容 |
| 第二章 试验材料与方法 |
| 2.1 试验材料 |
| 2.1.1 试验羊场概况 |
| 2.1.2 试验对象概况 |
| 2.1.3 饲养管理 |
| 2.2 试验方法 |
| 2.2.1 生长发育研究 |
| 2.2.2 行为学研究 |
| 2.2.3 常规生理指标研究 |
| 2.2.4 繁殖性能研究 |
| 2.2.5 数据统计与分析 |
| 第三章 试验结果与分析 |
| 3.1 生长发育的研究 |
| 3.1.1 承德无角山羊体重变化特点 |
| 3.1.2 承德无角羊体尺指标变化特点 |
| 3.1.3 承德无角山羊体重与体尺指标的相关分析 |
| 3.1.4 承德无角山羊体重与体尺指标的回归分析 |
| 3.2 行为学研究 |
| 3.3 常规生理指标研究 |
| 3.4 繁殖性能的研究 |
| 第四章 讨论 |
| 4.1 承德无角山羊生长发育情况 |
| 4.2 承德无角山羊行为学研究 |
| 4.3 承德无角山羊常规生理指标研究 |
| 4.4 承德无角山羊繁殖性能研究 |
| 第五章 结论 |
| 参考文献 |
| 发表论文和参加科研情况说明 |
| 论文受资助情况 |
| 致谢 |
（4）转口蹄疫VP1基因奶山羊体外胚胎生产及冷冻保存（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 文献综述 |
| 第一章 体外胚胎生产及胚胎玻璃化冷冻研究进展 |
| 1.1 体外胚胎生产研究进展 |
| 1.2 玻璃化冷冻研究进展 |
| 1.2.1 玻璃化冷冻的原理 |
| 1.2.2 胚胎冷冻的历史 |
| 1.2.3 玻璃化冷冻的方法 |
| 1.2.4 冷冻保护剂 |
| 1.2.5 胚胎冷冻的意义与展望 |
| 1.3 本论文研究的目的与意义 |
| 试验研究 |
| 第二章 转基因山羊的鉴定 |
| 2.1 材料 |
| 2.1.1 试验动物 |
| 2.1.2 试验试剂 |
| 2.1.3 试验仪器设备 |
| 2.2 方法 |
| 2.2.1 山羊血液基因组提取 |
| 2.2.2 山羊精液基因组提取 |
| 2.2.3 引物设计 |
| 2.2.4 PCR反应体系 |
| 2.2.5 PCR反应程序 |
| 2.2.6 琼脂糖凝胶回收测序鉴定 |
| 2.3 结果 |
| 2.3.1 转基因奶山羊血液基因组PCR鉴定 |
| 2.3.2 转基因奶山羊精液基因组PCR鉴定 |
| 2.3.3 测序结果 |
| 2.4 讨论 |
| 2.5 小结 |
| 第三章 转基因羊体外胚胎生产及冷冻保存 |
| 3.1 材料 |
| 3.1.1 试验动物、组织和细胞 |
| 3.1.2 试验试剂 |
| 3.1.3 试验仪器设备 |
| 3.2 方法 |
| 3.2.1 山羊卵母细胞采集和体外成熟 |
| 3.2.2 山羊精液采集 |
| 3.2.3 山羊卵母细胞体外受精和体外培养 |
| 3.2.4 胚胎冷冻液筛选 |
| 3.2.5 胚胎冷冻液优化 |
| 3.2.6 囊胚质量评级 |
| 3.2.7 胚胎冷冻与解冻 |
| 3.2.8 冷冻解冻后囊胚免疫荧光染色 |
| 3.2.9 冷冻解冻后囊胚凋亡检测 |
| 3.2.10 体外胚胎鉴定 |
| 3.2.11 同期发情 |
| 3.2.12 胚胎移植 |
| 3.2.13 数据统计与分析 |
| 3.3 结果 |
| 3.3.1 胚胎冷冻液筛选结果 |
| 3.3.2 胚胎冷冻液优化结果 |
| 3.3.3 冷冻对囊胚细胞数的影响 |
| 3.3.4 冷冻对囊胚细胞凋亡的影响 |
| 3.3.5 转基因胚胎体外生产效率 |
| 3.3.6 体外胚胎PCR鉴定 |
| 3.3.7 胚胎移植妊娠结果 |
| 3.4 讨论 |
| 3.5 小结 |
| 全文结论 |
| 附录 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（5）牦牛群体结构变异和驯化研究（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 第一章 研究背景 |
| 1.1 基因组学 |
| 1.1.1 基因组和基因组学 |
| 1.1.2 DNA测序技术 |
| 1.1.3 染色质构象捕获测序 |
| 1.1.4 基因组组装算法 |
| 1.2 基因组结构变异 |
| 1.2.1 结构变异及其研究进展 |
| 1.2.2 群体结构变异 |
| 1.3 动物驯化 |
| 1.3.1 动物驯化和驯化综合征 |
| 1.3.2 动物驯化的历史 |
| 1.3.3 动物驯化的遗传学基础 |
| 1.3.4 动物驯化的遗传学研究进展 |
| 1.4 牦牛 |
| 1.4.1 牦牛及其分类,分布和起源 |
| 1.4.2 牦牛驯化的遗传学研究进展 |
| 1.5 研究意义与科学问题 |
| 第二章 研究方法 |
| 2.1 基因组样品收集与测序 |
| 2.2 基因组组装 |
| 2.2.1 基因组Survey |
| 2.2.2 基于长读长数据的基因组组装 |
| 2.2.3 挂载基因组到染色体水平 |
| 2.3 基因组注释 |
| 2.3.1 基因组结构预测 |
| 2.3.2 编码基因功能注释 |
| 2.4 基因组组装和注释质量评估 |
| 2.4.1 组装质量评估 |
| 2.4.2 注释质量评估 |
| 2.5 基因组个性化分析 |
| 2.5.1 共线性分析 |
| 2.5.2 系统发育分析 |
| 2.5.3 基因家族分析 |
| 2.6 全基因组SNV遗传变异分析 |
| 2.6.1 测序数据质量评估及控制 |
| 2.6.2 全基因组序列比对 |
| 2.6.3 遗传变异鉴定 |
| 2.6.4 个体亲缘关系鉴定 |
| 2.6.5 系统发育分析 |
| 2.6.6 基于SNP的群体结构分析 |
| 2.7 群体结构变异鉴定 |
| 2.7.1 长读长测序数据质量控制 |
| 2.7.2 基于长读长数据的结构变异鉴定 |
| 2.7.3 基于短读长数据的结构变异鉴定 |
| 2.7.4 基于基因组组装的结构变异鉴定 |
| 2.7.5 结构变异一致性序列提取和注释 |
| 2.8 基于结构变异的基因组学分析 |
| 2.8.1 基于结构变异的系统发育分析 |
| 2.8.2 基于结构变异的群体结构分析 |
| 2.8.3 受选择的结构变异鉴定和注释 |
| 2.8.4 相关基因的功能富集和注释 |
| 第三章 研究结果 |
| 3.1 样品收集与测序 |
| 3.2 基因组Survey分析 |
| 3.2.1 基因组大小推断 |
| 3.2.2 基因组测序污染分析 |
| 3.2.3 基因组初步组装 |
| 3.3 基因组组装 |
| 3.3.1 基于三代测序的基因组组装 |
| 3.3.2 基于Hi-C组装的Contig挂载 |
| 3.4 基因组注释 |
| 3.4.1 重复序列预测 |
| 3.4.2 非编码RNA预测 |
| 3.4.3 蛋白编码基因预测 |
| 3.4.4 蛋白编码功能注释 |
| 3.5 基因组概况和质量评估 |
| 3.6 基因组个性化分析 |
| 3.6.1 共线性分析 |
| 3.6.2 基因家族鉴定 |
| 3.6.3 系统发育分析 |
| 3.7 群体SNV变异分析 |
| 3.7.0 样本收集与测序 |
| 3.7.1 序列比对和SNV变异鉴定 |
| 3.7.2 亲缘关系分析 |
| 3.7.3 系统发育分析 |
| 3.7.4 群体结构分析 |
| 3.8 结构变异分析 |
| 3.8.1 基于短读长的结构变异鉴定 |
| 3.8.2 基于基因组比对的结构变异鉴定 |
| 3.8.3 样本收集与测序 |
| 3.8.4 基于长度长的结构变异鉴定 |
| 3.8.5 结构变异注释 |
| 3.8.6 群体结构变异分析 |
| 3.8.7 结构变异相关基因注释 |
| 第四章 讨论与展望 |
| 4.1 家牦牛染色体水平的参考基因组 |
| 4.2 牦牛群体结构变异与牦牛驯化 |
| 4.3 展望 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 在学期间的研究成果 |
| 致谢 |
（6）鹿科动物基因组学研究进展（论文提纲范文）
| 1 鹿科动物基因组资源 |
| 1.1 基因组参考序列 |
| 1.2 基因组变异资源 |
| 2 比较基因组学 |
| 2.1 染色体核型进化 |
| 2.2 适应性进化 |
| 2.3 再生器官(鹿茸角)起源进化关键基因 |
| 3 功能基因组学 |
| 3.1 鹿茸干细胞 |
| 3.2 鹿茸生长中心 |
| 4 结语与展望 |
（7）陕北白绒山羊农户舍饲养殖典型日粮分析研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第一章 文献综述 |
| 1.1 国内绒山羊的地理分布 |
| 1.1.1 我国主要绒山羊品种地理分布及产绒性能、繁殖性能 |
| 1.1.1.1 北方牧区 |
| 1.1.1.2 青藏高原区 |
| 1.1.1.3 农牧混合区 |
| 1.1.1.4 北方农区 |
| 1.1.1.5 南方牧区 |
| 1.1.2 我国主要地方品种绒山羊的养殖情况 |
| 1.2 山羊常用饲料研究进展 |
| 1.2.1 山羊常用饲料类型的研究进展 |
| 1.2.2 羊常用饲料的营养价值评价研究进展 |
| 1.2.3 山羊粗饲料的开发和利用 |
| 1.3 反刍动饲料营养价值评定 |
| 1.3.1 反刍动物消化特点 |
| 1.3.2 评定反刍动物饲料营养成分的方法 |
| 1.3.3 评定反刍动物饲料营养物质瘤胃降解的方法 |
| 1.3.3.1 体内法 |
| 1.3.3.2 半体内法 |
| 1.3.3.3 体外法 |
| 1.4 陕北白绒山羊养殖存在的问题 |
| 1.4.1 养殖存在的问题 |
| 1.4.1.1 规模化养殖与经济收益的矛盾 |
| 1.4.1.2 饲养管理水平较低 |
| 1.4.1.3 品种退化,绒毛品质下降 |
| 1.5 本研究的目的和意义 |
| 1.6 研究的技术路线图 |
| 第二章 陕北白绒山羊农户舍饲养殖常用饲料调研分析 |
| 2.1 调研思路、方法与内容 |
| 2.1.1 调研的思路 |
| 2.1.2 方法与内容 |
| 2.1.3 数据处理与分析 |
| 2.2 调查结果与分析 |
| 2.3 讨论 |
| 2.3.1 饲料的基本情况 |
| 2.3.2 日粮组分和组合 |
| 2.4 小结 |
| 第三章 评定陕北白绒山羊6种常用粗饲料营养价值 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 试验动物及饲粮 |
| 3.1.2 样品采集和实验材料 |
| 3.1.3 试验设计 |
| 3.1.4 测定指标及方法 |
| 3.1.5 计算方法 |
| 3.1.6 统计与分析 |
| 3.2 试验结果与分析 |
| 3.2.1 常规营养成分分析 |
| 3.2.2 饲料干物质降解率 |
| 3.2.3 饲料蛋白质降解率 |
| 3.3 讨论 |
| 3.3.1 DM瘤胃降解特性 |
| 3.3.2 CP瘤胃降解特性 |
| 3.4 小结 |
| 第四章 陕北白绒山羊常用饲料常规营养成分及黄曲霉毒素含量分析 |
| 4.1 材料与方法 |
| 4.1.1 样品采集和制备 |
| 4.1.2 测定指标及方法 |
| 4.1.3 统计与分析 |
| 4.2 试验结果与分析 |
| 4.2.1 常规营养成分 |
| 4.2.2 黄曲霉毒素B1含量分析 |
| 4.2.3 典型日粮组合黄曲霉毒素B1分析 |
| 4.2.4 典型日粮组合营养水平 |
| 4.3 讨论 |
| 4.3.1 常规营养成分分析 |
| 4.3.2 黄曲霉毒素产生分析 |
| 4.3.3 典型日粮营养水平分析 |
| 4.3.4 典型日粮黄曲霉毒素B1含量情况 |
| 4.4 小结 |
| 第五章 结论 |
| 5.1 结论 |
| 5.2 创新点 |
| 5.3 有待深入分析研究的问题 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（8）荞麦秸秆日粮中添加甘露寡糖对滩羊生产性能、免疫和抗氧化功能的影响（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第一章 引言 |
| 1 选题背景 |
| 2 秸秆饲用化技术 |
| 2.1 物理处理法 |
| 2.2 化学处理法 |
| 2.3 生物学处理法 |
| 3 甘露寡糖的作用及其应用效果 |
| 3.1 甘露寡糖的生理功能 |
| 3.2 甘露寡糖对动物机体抗氧化功能的影响 |
| 3.3 甘露寡糖的饲喂效果 |
| 4 过瘤胃氨基酸研究进展 |
| 4.1 过瘤胃氨基酸的保护方法 |
| 4.2 过瘤胃氨基酸的应用效果 |
| 5 研究目的及意义 |
| 6 技术路线 |
| 第二章 甘露寡糖对滩羊瘤胃发酵参数和消化代谢的影响 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验设计 |
| 1.2 基础饲粮 |
| 1.3 饲养管理 |
| 1.4 消化代谢 |
| 1.5 试验样品采集与测定 |
| 1.6 数据统计与分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 添加甘露寡糖对滩羊瘤胃发酵参数的影响 |
| 2.2 添加甘露寡糖对滩羊消化代谢的影响 |
| 3 讨论 |
| 3.1 添加甘露寡糖对滩羊瘤胃发酵参数的影响 |
| 3.2 添加甘露寡糖对滩羊消化代谢的影响 |
| 4 小结 |
| 第三章 甘露寡糖对滩羊血液生化指标的影响 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验设计 |
| 1.2 基础饲粮 |
| 1.3 饲养管理 |
| 1.4 试验样品采集与测定 |
| 1.5 数据统计与分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 添加甘露寡糖对滩羊血清蛋白含量的影响 |
| 2.2 添加甘露寡糖对滩羊血清葡萄糖含量的影响 |
| 2.3 添加甘露寡糖对滩羊血清UREA、TG、TC、FFA的影响 |
| 3 讨论 |
| 3.1 添加甘露寡糖对滩羊血清蛋白含量的影响 |
| 3.2 添加甘露寡糖对滩羊血清葡萄糖含量的影响 |
| 3.3 添加甘露寡糖对滩羊血清UREA、TG、TC、FFA的影响 |
| 4 小结 |
| 第四章 甘露寡糖对滩羊免疫和抗氧化功能的影响 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验设计 |
| 1.2 基础饲粮 |
| 1.3 饲养管理 |
| 1.4 试验样品采集与测定 |
| 1.5 数据统计与分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 添加甘露寡糖对滩羊免疫功能的影响 |
| 2.2 添加甘露寡糖对滩羊抗氧化功能的影响 |
| 3 讨论 |
| 3.1 添加甘露寡糖对滩羊免疫功能的影响 |
| 3.2 添加甘露寡糖对滩羊抗氧化功能的影响 |
| 4 小结 |
| 第五章 甘露寡糖对滩羊生长性能、屠宰性能及肉品质的影响 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验设计 |
| 1.2 基础饲粮 |
| 1.3 饲养管理 |
| 1.4 试验方法及样品采集 |
| 1.5 试验样品分析测试 |
| 1.6 数据统计与分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 添加甘露寡糖对滩羊生长性能的影响 |
| 2.2 添加甘露寡糖对滩羊屠宰性能的影响 |
| 2.3 添加甘露寡糖对滩羊肉品质的影响 |
| 3 讨论 |
| 3.1 添加甘露寡糖对滩羊生长性能的影响 |
| 3.2 添加甘露寡糖对滩羊屠宰性能的影响 |
| 3.3 添加甘露寡糖对滩羊肉品质的影响 |
| 4 小结 |
| 第六章 论文总体结论与创新点 |
| 1 总体结论 |
| 2 创新点 |
| 3 未来研究展望 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 个人简介 |
（9）2035kg川中黑山羊公羊能量和蛋白质需要量研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 缩略词表 |
| 前言 |
| 第一章 文献综述 |
| 1.1 肉类产品消费与肉羊养殖现状 |
| 1.2 川中黑山羊 |
| 1.3 肉羊营养需要研究进展 |
| 1.3.1 国外肉羊营养需要研究现状 |
| 1.3.2 国内肉羊营养需要研究现状 |
| 1.4 肉羊能量的研究方法 |
| 1.4.1 肉羊能量需要评定体系 |
| 1.4.2 肉羊能量需要常用研究方法 |
| 1.5 肉羊蛋白质需要的研究方法 |
| 1.5.1 肉羊蛋白质需要评定体系 |
| 1.5.2 肉羊蛋白质需要研究方法 |
| 1.6 本研究的目的及意义 |
| 第二章 试验部分 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 试验时间与地点 |
| 2.1.2 试验动物与试验设计 |
| 2.1.3 试验日粮 |
| 2.1.4 饲养管理 |
| 2.1.5 试验方法和样品采集 |
| 2.1.5.1 消化代谢试验 |
| 2.1.5.2 比较屠宰试验 |
| 2.1.6 指标测定及方法 |
| 2.1.7 数据统计分析 |
| 2.2 结果与分析 |
| 2.2.1 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊生长性能的影响 |
| 2.2.2 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊屠宰性能的影响 |
| 2.2.3 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊养分表观消化率的影响 |
| 2.2.4 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊能量代谢和氮代谢的影响 |
| 2.2.5 20~35kg川中黑山羊公羊能量需要量 |
| 2.2.6 20~35kg川中黑山羊公羊净蛋白质需要量 |
| 2.3 讨论 |
| 2.3.1 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊生长性能的影响 |
| 2.3.2 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊屠宰性能的影响 |
| 2.3.3 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊养分表观消化率的影响 |
| 2.3.4 饲喂水平对20~35kg川中黑山羊公羊能量代谢和氮代谢的影响 |
| 2.3.5 20~35kg川中黑山羊公羊能量需要量 |
| 2.3.6 20~35kg川中黑山羊公羊净蛋白质需要量 |
| 第三章 结论 |
| 3.1 主要结论 |
| 3.2 主要创新点 |
| 3.3 有待进一步研究的问题 |
| 附录 |
| 参考文献 |
| 作者简介 |
| 致谢 |
（10）牛至精油替代莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃功能和生长性能的影响（论文提纲范文）
| 摘要 |
| SUMMARY |
| 缩略词表 |
| 第一章 文献综述 |
| 1.牛至的应用 |
| 1.1 基于CiteSpace的国际牛至研究知识图谱分析 |
| 1.1.1 材料与方法 |
| 1.1.2 数据来源 |
| 1.2 牛至相关文献的分析 |
| 1.2.1 国际发文情况分析 |
| 1.2.2 牛至研究的高被引文献分析 |
| 1.2.3 牛至研究的主要国家、合作机构以及作者分析 |
| 1.2.4 根据高频关键词分析有关牛至研究领域的研究前沿和热点 |
| 1.2.5 文献聚类分析 |
| 1.3 小结 |
| 1.4 植物精油促生长的作用模式及其在动物生产中的应用 |
| 1.4.1 改善饲粮适口性并提高采食量 |
| 1.4.2 瘤胃发酵调控 |
| 1.4.3 对营养物质的消化和吸收能力 |
| 1.4.4 免疫刺激和抗氧化作用 |
| 2.莫能菌素的应用 |
| 3.本研究的目的和意义 |
| 4.研究内容及技术路线 |
| 4.1 研究内容 |
| 4.2 技术路线 |
| 第二章 试验研究 |
| 试验一 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃微生物区系的影响 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 试验时间和地点 |
| 1.2 试验动物和饲粮组成 |
| 1.3 试验设计及饲养管理 |
| 1.4 样品采集与处理 |
| 1.5 微生物DNA提取 |
| 1.6 16S rDNA基因V3-V4区的PCR扩增 |
| 1.7 测序数据质量控制及预处理 |
| 1.8 统计分析 |
| 2.结果分析 |
| 2.1 瘤胃微生物16S rDNA基因测序质量和Alpha多样性 |
| 2.2 瘤胃微生物Beta多样性 |
| 2.3 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃微生物区系组成的影响 |
| 2.3.1 牛至精油和莫能菌素对瘤胃微生物门水平上相对丰度的影响 |
| 2.3.2 牛至精油和莫能菌素对瘤胃微生物科水平上相对丰度的影响 |
| 2.3.3 牛至精油和莫能菌素对瘤胃微生物属水平上相对丰度的影响 |
| 3.讨论 |
| 3.1 牛至精油和莫能菌素对瘤胃OTUs丰度和多样性的影响 |
| 3.2 牛至精油和莫能菌素对瘤胃微生物区系门水平上的影响 |
| 3.3 牛至精油和莫能菌素对瘤胃微生物区系科水平上的影响 |
| 3.4 牛至精油和莫能菌素对瘤胃微生物区系属水平上的影响 |
| 4 小结 |
| 试验二 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃发酵参数和微生物酶活性的影响 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 试验时间和地点 |
| 1.2 试验动物和饲粮 |
| 1.3 试验设计及饲养管理 |
| 1.4 样品采集及处理 |
| 1.5 测定指标 |
| 1.6 统计分析 |
| 2.结果分析 |
| 2.1 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛发酵参数的影响 |
| 2.2 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃微生物酶活性的影响 |
| 3.讨论 |
| 3.1 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃发酵参数的影响 |
| 3.2 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃微生物酶活性的影响 |
| 4.小结 |
| 试验三 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛生长性能的影响 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 试验时间和地点 |
| 1.2 试验动物和饲粮 |
| 1.3 试验设计及饲养管理 |
| 1.4 体重和体尺测定 |
| 1.5 统计分析 |
| 2.结果与分析 |
| 2.1 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛体重的影响 |
| 2.2 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛体尺指标的影响 |
| 3.讨论 |
| 3.1 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛干物质采食量和饲料效率的影响 |
| 3.2 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛生长性能的影响 |
| 4.小结 |
| 试验四 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清指标的影响 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 试验时间和地点 |
| 1.2 试验动物和饲粮 |
| 1.3 试验设计及饲养管理 |
| 1.4 样品采集及处理 |
| 1.5 统计分析 |
| 2.结果与分析 |
| 2.1 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清生化指标的影响 |
| 2.2 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清脂代谢指标的影响 |
| 2.3 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清抗氧化指标的影响 |
| 2.4 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清免疫指标的影响 |
| 3.讨论 |
| 3.1 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清生化指标的影响 |
| 3.2 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清脂代谢指标的影响 |
| 3.3 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清抗氧化指标的影响 |
| 3.4 牛至精油和莫能菌素对荷斯坦奶公牛血清免疫指标的影响 |
| 4.小结 |
| 第三章 总结 |
| 1.本研究的主要结论 |
| 2.本研究的主要创新点 |
| 3.本研究的不足之处及需要进一步研究的问题 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 致谢 |
| 个人简介 |
| 导师简介 |
四、小反刍动物遗传资源保护技术研究进展（论文参考文献）
- [1]牛早期妊娠诊断的研究进展[J]. 郭腾龙,汝振远,任尚,杨贤树,张翔栋,申屠璐燕,张运海,曹祖兵. 畜牧与兽医, 2021(08)
- [2]山羊SNP芯片设计与内蒙古绒山羊重要经济性状全基因组关联分析及基因组选择研究[D]. 王凤红. 内蒙古农业大学, 2021
- [3]平原地区舍饲条件下承德无角山羊种质特性研究[D]. 刘佳倩. 河北科技师范学院, 2021(08)
- [4]转口蹄疫VP1基因奶山羊体外胚胎生产及冷冻保存[D]. 褚博. 西北农林科技大学, 2021(01)
- [5]牦牛群体结构变异和驯化研究[D]. 张上哲. 兰州大学, 2021
- [6]鹿科动物基因组学研究进展[J]. 巴恒星,胡鹏飞,李春义. 遗传, 2021(04)
- [7]陕北白绒山羊农户舍饲养殖典型日粮分析研究[D]. 王荣斌. 西北农林科技大学, 2020(03)
- [8]荞麦秸秆日粮中添加甘露寡糖对滩羊生产性能、免疫和抗氧化功能的影响[D]. 杨万宗. 宁夏大学, 2020(03)
- [9]2035kg川中黑山羊公羊能量和蛋白质需要量研究[D]. 吴璇. 西南民族大学, 2020
- [10]牛至精油替代莫能菌素对荷斯坦奶公牛瘤胃功能和生长性能的影响[D]. 柏妍. 甘肃农业大学, 2020